Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCP1P17987 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCP1P17987 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCP1P17987 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCP1P17987 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCP1P17987 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCP1P17987 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCP1P17987 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCP1P17987 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TCP1P17987 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP1P17987 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP1P17987 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TCP1P17987 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TCP1P17987 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCP1P17987 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCP1P17987 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCP1P17987 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TCP1P17987 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCP1P17987 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCP1P17987 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCP1P17987 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCP1P17987 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCP1P17987 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCP1P17987 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TCP1P17987 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCP1P17987 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCP1P17987 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TCP1P17987 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP1P17987 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP1P17987 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP1P17987 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP1P17987 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP1P17987 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP1P17987 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP1P17987 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP1P17987 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TCP1P17987 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCP1P17987 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TCP1P17987 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCP1P17987 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TCP1P17987 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCP1P17987 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TCP1P17987 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCP1P17987 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCP1P17987 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TCP1P17987 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP1P17987 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP1P17987 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TCP1P17987 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TCP1P17987 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP1P17987 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP1P17987 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCP1P17987 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCP1P17987 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCP1P17987 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCP1P17987 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCP1P17987 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCP1P17987 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCP1P17987 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCP1P17987 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCP1P17987 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCP1P17987 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCP1P17987 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP1P17987 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP1P17987 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP1P17987 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP1P17987 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP1P17987 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TCP1P17987 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCP1P17987 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCP1P17987 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TCP1P17987 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCP1P17987 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCP1P17987 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP1P17987 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP1P17987 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP1P17987 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP1P17987 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP1P17987 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCP1P17987 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP1P17987 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP1P17987 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP1P17987 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP1P17987 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP1P17987 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCP1P17987 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP1P17987 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP1P17987 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP1P17987 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP1P17987 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP1P17987 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCP1P17987 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCP1P17987 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCP1P17987 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCP1P17987 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TCP1P17987 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCP1P17987 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCP1P17987 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCP1P17987 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCP1P17987 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms