Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DESP17661 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DESP17661 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DESP17661 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DESP17661 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DESP17661 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DESP17661 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DESP17661 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DESP17661 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DESP17661 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DESP17661 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DESP17661 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DESP17661 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DESP17661 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DESP17661 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DESP17661 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DESP17661 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DESP17661 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DESP17661 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DESP17661 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DESP17661 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DESP17661 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DESP17661 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DESP17661 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DESP17661 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DESP17661 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DESP17661 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DESP17661 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DESP17661 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DESP17661 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DESP17661 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DESP17661 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DESP17661 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DESP17661 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DESP17661 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DESP17661 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DESP17661 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DESP17661 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DESP17661 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DESP17661 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DESP17661 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DESP17661 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DESP17661 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DESP17661 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DESP17661 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DESP17661 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DESP17661 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DESP17661 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DESP17661 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DESP17661 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DESP17661 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DESP17661 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DESP17661 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DESP17661 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DESP17661 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DESP17661 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DESP17661 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DESP17661 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DESP17661 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DESP17661 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DESP17661 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DESP17661 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DESP17661 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DESP17661 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DESP17661 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DESP17661 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DESP17661 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DESP17661 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DESP17661 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DESP17661 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DESP17661 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DESP17661 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DESP17661 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DESP17661 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DESP17661 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DESP17661 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DESP17661 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DESP17661 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DESP17661 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DESP17661 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DESP17661 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DESP17661 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DESP17661 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DESP17661 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DESP17661 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DESP17661 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms