Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXB6P17509 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXB6P17509 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXB6P17509 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms