Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptbp1P17225 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptbp1P17225 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptbp1P17225 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptbp1P17225 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms