Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou4f1P17208 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pou4f1P17208 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou4f1P17208 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pou4f1P17208 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pou4f1P17208 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms