Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCL3L1P16619 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCL3L1P16619 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCL3L1P16619 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCL3L1P16619 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms