Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP2A2P16615 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP2A2P16615 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2A2P16615 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2A2P16615 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A2P16615 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A2P16615 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A2P16615 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A2P16615 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A2P16615 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A2P16615 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A2P16615 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A2P16615 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A2P16615 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A2P16615 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A2P16615 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP2A2P16615 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A2P16615 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A2P16615 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A2P16615 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A2P16615 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP2A2P16615 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP2A2P16615 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms