Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkceP16054 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkceP16054 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkceP16054 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PrkceP16054 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkceP16054 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkceP16054 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkceP16054 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkceP16054 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrkceP16054 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrkceP16054 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PrkceP16054 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PrkceP16054 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkceP16054 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkceP16054 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkceP16054 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkceP16054 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkceP16054 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkceP16054 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkceP16054 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrkceP16054 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkceP16054 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkceP16054 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkceP16054 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkceP16054 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkceP16054 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkceP16054 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrkceP16054 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PrkceP16054 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PrkceP16054 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms