Protein–RNA interactions for Protein: P15621

ZNF44, Zinc finger protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF44P15621 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF44P15621 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF44P15621 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF44P15621 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF44P15621 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF44P15621 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF44P15621 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF44P15621 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF44P15621 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF44P15621 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF44P15621 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF44P15621 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF44P15621 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF44P15621 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF44P15621 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF44P15621 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF44P15621 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF44P15621 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF44P15621 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF44P15621 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF44P15621 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF44P15621 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms