Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme1P15532 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme1P15532 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme1P15532 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme1P15532 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme1P15532 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme1P15532 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme1P15532 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme1P15532 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme1P15532 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme1P15532 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme1P15532 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme1P15532 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nme1P15532 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme1P15532 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme1P15532 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nme1P15532 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms