Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXB3P14651 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB3P14651 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.3 ms