Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NID1P14543 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NID1P14543 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NID1P14543 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NID1P14543 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NID1P14543 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NID1P14543 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NID1P14543 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NID1P14543 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NID1P14543 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NID1P14543 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NID1P14543 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NID1P14543 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NID1P14543 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NID1P14543 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NID1P14543 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NID1P14543 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NID1P14543 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NID1P14543 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NID1P14543 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NID1P14543 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NID1P14543 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NID1P14543 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NID1P14543 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NID1P14543 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NID1P14543 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NID1P14543 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NID1P14543 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NID1P14543 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NID1P14543 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NID1P14543 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NID1P14543 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NID1P14543 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NID1P14543 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NID1P14543 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NID1P14543 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NID1P14543 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NID1P14543 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NID1P14543 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NID1P14543 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NID1P14543 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NID1P14543 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NID1P14543 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NID1P14543 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NID1P14543 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NID1P14543 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NID1P14543 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NID1P14543 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NID1P14543 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NID1P14543 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NID1P14543 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NID1P14543 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NID1P14543 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NID1P14543 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NID1P14543 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NID1P14543 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NID1P14543 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NID1P14543 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NID1P14543 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NID1P14543 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NID1P14543 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NID1P14543 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NID1P14543 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NID1P14543 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NID1P14543 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NID1P14543 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NID1P14543 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NID1P14543 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NID1P14543 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NID1P14543 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NID1P14543 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NID1P14543 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NID1P14543 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NID1P14543 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NID1P14543 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NID1P14543 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NID1P14543 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NID1P14543 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NID1P14543 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NID1P14543 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NID1P14543 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NID1P14543 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NID1P14543 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NID1P14543 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NID1P14543 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NID1P14543 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NID1P14543 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NID1P14543 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NID1P14543 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NID1P14543 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NID1P14543 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NID1P14543 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NID1P14543 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NID1P14543 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NID1P14543 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NID1P14543 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NID1P14543 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NID1P14543 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NID1P14543 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NID1P14543 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms