Protein–RNA interactions for Protein: P13439

Umps, Uridine 5'-monophosphate synthase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UmpsP13439 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UmpsP13439 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UmpsP13439 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UmpsP13439 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UmpsP13439 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UmpsP13439 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UmpsP13439 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UmpsP13439 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UmpsP13439 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UmpsP13439 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UmpsP13439 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UmpsP13439 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms