Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vpreb1P13372 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vpreb1P13372 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb1P13372 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms