Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEFA4P12838 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DEFA4P12838 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DEFA4P12838 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms