Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RLBP1P12271 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RLBP1P12271 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RLBP1P12271 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
RLBP1P12271 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RLBP1P12271 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
RLBP1P12271 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RLBP1P12271 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RLBP1P12271 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RLBP1P12271 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RLBP1P12271 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RLBP1P12271 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RLBP1P12271 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RLBP1P12271 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RLBP1P12271 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RLBP1P12271 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RLBP1P12271 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms