Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTHFD1P11586 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTHFD1P11586 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MTHFD1P11586 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTHFD1P11586 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms