Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DMDP11532 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DMDP11532 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DMDP11532 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DMDP11532 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DMDP11532 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DMDP11532 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DMDP11532 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DMDP11532 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DMDP11532 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DMDP11532 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DMDP11532 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DMDP11532 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DMDP11532 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DMDP11532 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DMDP11532 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DMDP11532 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DMDP11532 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DMDP11532 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DMDP11532 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DMDP11532 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DMDP11532 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DMDP11532 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DMDP11532 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DMDP11532 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DMDP11532 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DMDP11532 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DMDP11532 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DMDP11532 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DMDP11532 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DMDP11532 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DMDP11532 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DMDP11532 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DMDP11532 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DMDP11532 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DMDP11532 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DMDP11532 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DMDP11532 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DMDP11532 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DMDP11532 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DMDP11532 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DMDP11532 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DMDP11532 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DMDP11532 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DMDP11532 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DMDP11532 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DMDP11532 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DMDP11532 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DMDP11532 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DMDP11532 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DMDP11532 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DMDP11532 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DMDP11532 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DMDP11532 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DMDP11532 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DMDP11532 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DMDP11532 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DMDP11532 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DMDP11532 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DMDP11532 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DMDP11532 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DMDP11532 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DMDP11532 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DMDP11532 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DMDP11532 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DMDP11532 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DMDP11532 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DMDP11532 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DMDP11532 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DMDP11532 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DMDP11532 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DMDP11532 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DMDP11532 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DMDP11532 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DMDP11532 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DMDP11532 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DMDP11532 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DMDP11532 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DMDP11532 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DMDP11532 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DMDP11532 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DMDP11532 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DMDP11532 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DMDP11532 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DMDP11532 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DMDP11532 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DMDP11532 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DMDP11532 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DMDP11532 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DMDP11532 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DMDP11532 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DMDP11532 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DMDP11532 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DMDP11532 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DMDP11532 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DMDP11532 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DMDP11532 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DMDP11532 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DMDP11532 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DMDP11532 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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