Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTBP11277 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBP11277 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBP11277 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBP11277 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBP11277 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBP11277 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBP11277 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBP11277 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBP11277 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTBP11277 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBP11277 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBP11277 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTBP11277 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBP11277 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBP11277 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBP11277 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTBP11277 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTBP11277 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBP11277 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBP11277 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTBP11277 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBP11277 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBP11277 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBP11277 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBP11277 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTBP11277 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBP11277 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBP11277 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTBP11277 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTBP11277 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTBP11277 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTBP11277 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTBP11277 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTBP11277 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTBP11277 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTBP11277 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTBP11277 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBP11277 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBP11277 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBP11277 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBP11277 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBP11277 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBP11277 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPTBP11277 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBP11277 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBP11277 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBP11277 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBP11277 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBP11277 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPTBP11277 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBP11277 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBP11277 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPTBP11277 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBP11277 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBP11277 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPTBP11277 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTBP11277 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTBP11277 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTBP11277 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTBP11277 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPTBP11277 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPTBP11277 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTBP11277 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTBP11277 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTBP11277 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTBP11277 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTBP11277 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTBP11277 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTBP11277 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTBP11277 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPTBP11277 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPTBP11277 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTBP11277 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTBP11277 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPTBP11277 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTBP11277 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTBP11277 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTBP11277 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTBP11277 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTBP11277 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTBP11277 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPTBP11277 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTBP11277 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTBP11277 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTBP11277 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTBP11277 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPTBP11277 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTBP11277 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTBP11277 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTBP11277 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTBP11277 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPTBP11277 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTBP11277 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPTBP11277 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTBP11277 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTBP11277 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTBP11277 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPTBP11277 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPTBP11277 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms