Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRM1P11229 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHRM1P11229 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHRM1P11229 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRM1P11229 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms