Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CALM3P0DP25 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CALM3P0DP25 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CALM3P0DP25 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CALM3P0DP25 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CALM3P0DP25 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms