Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem254aP0DN89 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tmem254aP0DN89 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmem254aP0DN89 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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