Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
U2AF1L5P0DN76 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
U2AF1L5P0DN76 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
U2AF1L5P0DN76 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
U2AF1L5P0DN76 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
U2AF1L5P0DN76 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
U2AF1L5P0DN76 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
U2AF1L5P0DN76 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms