Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN8OSP0DMR3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATXN8OSP0DMR3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN8OSP0DMR3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN8OSP0DMR3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN8OSP0DMR3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN8OSP0DMR3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN8OSP0DMR3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN8OSP0DMR3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms