Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF888P0CJ79 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF888P0CJ79 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF888P0CJ79 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF888P0CJ79 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms