Protein–RNA interactions for Protein: P0C8K7

Smim1, Small integral membrane protein 1, mousemouse

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Length 78 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim1P0C8K7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim1P0C8K7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Smim1P0C8K7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim1P0C8K7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim1P0C8K7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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