Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
C4AP0C0L4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
C4AP0C0L4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
C4AP0C0L4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
C4AP0C0L4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
C4AP0C0L4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms