Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NclP09405 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NclP09405 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NclP09405 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NclP09405 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NclP09405 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NclP09405 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NclP09405 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NclP09405 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NclP09405 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NclP09405 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NclP09405 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NclP09405 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NclP09405 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NclP09405 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NclP09405 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NclP09405 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NclP09405 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NclP09405 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NclP09405 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NclP09405 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NclP09405 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NclP09405 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NclP09405 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NclP09405 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NclP09405 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NclP09405 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NclP09405 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
NclP09405 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NclP09405 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NclP09405 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NclP09405 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NclP09405 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NclP09405 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NclP09405 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NclP09405 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NclP09405 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NclP09405 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NclP09405 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NclP09405 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NclP09405 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NclP09405 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NclP09405 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NclP09405 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NclP09405 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NclP09405 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NclP09405 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NclP09405 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NclP09405 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NclP09405 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NclP09405 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NclP09405 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NclP09405 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NclP09405 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NclP09405 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NclP09405 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NclP09405 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NclP09405 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NclP09405 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NclP09405 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NclP09405 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NclP09405 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NclP09405 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NclP09405 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NclP09405 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NclP09405 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NclP09405 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NclP09405 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NclP09405 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NclP09405 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NclP09405 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NclP09405 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NclP09405 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NclP09405 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NclP09405 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NclP09405 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NclP09405 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NclP09405 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NclP09405 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NclP09405 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
NclP09405 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NclP09405 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NclP09405 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NclP09405 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NclP09405 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NclP09405 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NclP09405 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NclP09405 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NclP09405 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NclP09405 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NclP09405 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NclP09405 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NclP09405 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NclP09405 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NclP09405 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NclP09405 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NclP09405 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NclP09405 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NclP09405 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NclP09405 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms