Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI1P08151 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI1P08151 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI1P08151 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI1P08151 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI1P08151 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI1P08151 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI1P08151 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI1P08151 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI1P08151 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI1P08151 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI1P08151 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI1P08151 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI1P08151 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI1P08151 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI1P08151 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI1P08151 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI1P08151 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI1P08151 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI1P08151 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI1P08151 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI1P08151 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI1P08151 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI1P08151 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI1P08151 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI1P08151 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI1P08151 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI1P08151 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI1P08151 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GLI1P08151 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI1P08151 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI1P08151 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI1P08151 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI1P08151 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI1P08151 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI1P08151 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI1P08151 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI1P08151 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI1P08151 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GLI1P08151 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI1P08151 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI1P08151 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI1P08151 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI1P08151 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI1P08151 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI1P08151 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI1P08151 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI1P08151 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI1P08151 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI1P08151 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI1P08151 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GLI1P08151 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI1P08151 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GLI1P08151 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI1P08151 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI1P08151 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI1P08151 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GLI1P08151 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI1P08151 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI1P08151 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI1P08151 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI1P08151 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI1P08151 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GLI1P08151 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GLI1P08151 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GLI1P08151 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GLI1P08151 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GLI1P08151 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GLI1P08151 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI1P08151 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI1P08151 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI1P08151 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI1P08151 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI1P08151 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI1P08151 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI1P08151 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI1P08151 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI1P08151 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI1P08151 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI1P08151 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI1P08151 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI1P08151 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI1P08151 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI1P08151 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI1P08151 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI1P08151 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI1P08151 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI1P08151 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI1P08151 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI1P08151 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI1P08151 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI1P08151 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI1P08151 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI1P08151 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI1P08151 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI1P08151 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI1P08151 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI1P08151 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI1P08151 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI1P08151 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms