Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERCC1P07992 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERCC1P07992 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC1P07992 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC1P07992 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC1P07992 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC1P07992 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC1P07992 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC1P07992 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERCC1P07992 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms