Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPM2P07951 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPM2P07951 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPM2P07951 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPM2P07951 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPM2P07951 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPM2P07951 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPM2P07951 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPM2P07951 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPM2P07951 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPM2P07951 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPM2P07951 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPM2P07951 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPM2P07951 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPM2P07951 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPM2P07951 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPM2P07951 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPM2P07951 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPM2P07951 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM2P07951 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM2P07951 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM2P07951 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM2P07951 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM2P07951 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPM2P07951 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPM2P07951 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPM2P07951 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPM2P07951 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPM2P07951 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TPM2P07951 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TPM2P07951 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPM2P07951 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPM2P07951 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPM2P07951 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPM2P07951 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM2P07951 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM2P07951 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM2P07951 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM2P07951 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPM2P07951 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM2P07951 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM2P07951 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM2P07951 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPM2P07951 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPM2P07951 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPM2P07951 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPM2P07951 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPM2P07951 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPM2P07951 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM2P07951 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM2P07951 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM2P07951 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM2P07951 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM2P07951 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM2P07951 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPM2P07951 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPM2P07951 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPM2P07951 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPM2P07951 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPM2P07951 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPM2P07951 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TPM2P07951 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPM2P07951 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPM2P07951 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPM2P07951 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TPM2P07951 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TPM2P07951 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TPM2P07951 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM2P07951 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM2P07951 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPM2P07951 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM2P07951 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM2P07951 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM2P07951 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM2P07951 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM2P07951 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPM2P07951 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM2P07951 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM2P07951 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM2P07951 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPM2P07951 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPM2P07951 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPM2P07951 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM2P07951 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM2P07951 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM2P07951 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM2P07951 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM2P07951 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM2P07951 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM2P07951 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPM2P07951 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TPM2P07951 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TPM2P07951 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM2P07951 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM2P07951 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM2P07951 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM2P07951 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM2P07951 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPM2P07951 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPM2P07951 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms