Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtrP07309 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TtrP07309 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtrP07309 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtrP07309 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TtrP07309 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TtrP07309 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtrP07309 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtrP07309 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtrP07309 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TtrP07309 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtrP07309 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtrP07309 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtrP07309 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TtrP07309 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtrP07309 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtrP07309 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtrP07309 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtrP07309 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtrP07309 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtrP07309 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtrP07309 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtrP07309 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtrP07309 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtrP07309 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtrP07309 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtrP07309 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtrP07309 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtrP07309 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TtrP07309 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TtrP07309 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TtrP07309 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtrP07309 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtrP07309 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtrP07309 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtrP07309 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TtrP07309 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TtrP07309 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TtrP07309 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TtrP07309 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtrP07309 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtrP07309 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtrP07309 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TtrP07309 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtrP07309 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtrP07309 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtrP07309 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtrP07309 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TtrP07309 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtrP07309 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtrP07309 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TtrP07309 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtrP07309 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtrP07309 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtrP07309 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtrP07309 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TtrP07309 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtrP07309 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtrP07309 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtrP07309 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtrP07309 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtrP07309 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtrP07309 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TtrP07309 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TtrP07309 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtrP07309 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtrP07309 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtrP07309 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtrP07309 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtrP07309 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtrP07309 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtrP07309 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TtrP07309 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtrP07309 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TtrP07309 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtrP07309 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtrP07309 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtrP07309 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtrP07309 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtrP07309 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtrP07309 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtrP07309 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtrP07309 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtrP07309 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TtrP07309 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TtrP07309 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtrP07309 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtrP07309 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtrP07309 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtrP07309 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TtrP07309 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtrP07309 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtrP07309 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TtrP07309 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtrP07309 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtrP07309 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtrP07309 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TtrP07309 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtrP07309 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TtrP07309 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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