Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Me1P06801 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Me1P06801 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Me1P06801 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Me1P06801 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Me1P06801 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Me1P06801 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Me1P06801 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Me1P06801 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Me1P06801 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Me1P06801 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Me1P06801 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Me1P06801 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Me1P06801 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Me1P06801 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Me1P06801 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Me1P06801 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Me1P06801 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Me1P06801 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Me1P06801 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Me1P06801 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Me1P06801 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Me1P06801 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Me1P06801 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Me1P06801 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Me1P06801 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Me1P06801 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Me1P06801 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Me1P06801 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Me1P06801 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Me1P06801 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Me1P06801 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Me1P06801 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Me1P06801 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Me1P06801 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Me1P06801 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Me1P06801 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Me1P06801 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Me1P06801 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Me1P06801 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Me1P06801 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Me1P06801 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Me1P06801 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Me1P06801 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Me1P06801 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Me1P06801 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Me1P06801 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Me1P06801 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Me1P06801 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Me1P06801 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Me1P06801 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Me1P06801 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Me1P06801 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Me1P06801 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Me1P06801 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Me1P06801 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Me1P06801 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Me1P06801 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Me1P06801 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Me1P06801 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Me1P06801 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Me1P06801 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Me1P06801 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Me1P06801 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Me1P06801 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Me1P06801 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Me1P06801 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Me1P06801 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Me1P06801 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Me1P06801 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Me1P06801 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Me1P06801 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Me1P06801 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Me1P06801 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Me1P06801 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Me1P06801 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Me1P06801 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Me1P06801 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Me1P06801 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Me1P06801 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Me1P06801 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Me1P06801 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Me1P06801 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Me1P06801 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Me1P06801 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Me1P06801 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Me1P06801 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Me1P06801 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Me1P06801 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Me1P06801 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Me1P06801 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Me1P06801 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Me1P06801 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Me1P06801 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Me1P06801 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Me1P06801 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Me1P06801 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Me1P06801 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Me1P06801 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Me1P06801 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms