Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA4P06727 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOA4P06727 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA4P06727 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOA4P06727 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOA4P06727 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA4P06727 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA4P06727 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA4P06727 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA4P06727 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOA4P06727 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOA4P06727 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOA4P06727 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOA4P06727 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA4P06727 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA4P06727 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA4P06727 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA4P06727 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APOA4P06727 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA4P06727 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA4P06727 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APOA4P06727 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA4P06727 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA4P06727 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA4P06727 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA4P06727 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APOA4P06727 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA4P06727 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA4P06727 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA4P06727 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA4P06727 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA4P06727 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APOA4P06727 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA4P06727 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA4P06727 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA4P06727 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA4P06727 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APOA4P06727 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOA4P06727 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APOA4P06727 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA4P06727 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA4P06727 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APOA4P06727 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA4P06727 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA4P06727 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APOA4P06727 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA4P06727 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA4P06727 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA4P06727 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOA4P06727 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA4P06727 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA4P06727 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOA4P06727 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA4P06727 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA4P06727 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA4P06727 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOA4P06727 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOA4P06727 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOA4P06727 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
APOA4P06727 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOA4P06727 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOA4P06727 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOA4P06727 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOA4P06727 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA4P06727 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA4P06727 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA4P06727 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA4P06727 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA4P06727 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA4P06727 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APOA4P06727 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA4P06727 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA4P06727 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA4P06727 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA4P06727 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOA4P06727 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOA4P06727 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
APOA4P06727 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOA4P06727 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APOA4P06727 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOA4P06727 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA4P06727 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA4P06727 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA4P06727 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA4P06727 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA4P06727 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA4P06727 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA4P06727 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA4P06727 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA4P06727 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA4P06727 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA4P06727 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOA4P06727 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA4P06727 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA4P06727 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA4P06727 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA4P06727 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA4P06727 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOA4P06727 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOA4P06727 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms