Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1P04632 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1P04632 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPNS1P04632 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1P04632 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1P04632 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms