Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRB1P04280 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRB1P04280 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRB1P04280 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRB1P04280 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRB1P04280 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRB1P04280 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRB1P04280 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRB1P04280 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRB1P04280 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRB1P04280 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRB1P04280 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRB1P04280 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRB1P04280 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRB1P04280 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRB1P04280 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRB1P04280 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRB1P04280 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRB1P04280 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRB1P04280 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRB1P04280 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRB1P04280 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRB1P04280 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRB1P04280 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRB1P04280 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRB1P04280 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRB1P04280 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRB1P04280 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRB1P04280 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRB1P04280 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRB1P04280 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRB1P04280 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRB1P04280 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRB1P04280 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRB1P04280 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRB1P04280 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRB1P04280 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRB1P04280 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRB1P04280 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRB1P04280 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRB1P04280 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRB1P04280 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRB1P04280 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRB1P04280 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRB1P04280 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRB1P04280 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRB1P04280 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRB1P04280 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRB1P04280 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRB1P04280 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRB1P04280 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRB1P04280 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRB1P04280 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRB1P04280 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRB1P04280 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRB1P04280 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRB1P04280 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRB1P04280 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRB1P04280 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRB1P04280 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRB1P04280 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRB1P04280 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRB1P04280 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRB1P04280 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRB1P04280 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRB1P04280 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRB1P04280 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRB1P04280 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRB1P04280 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRB1P04280 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRB1P04280 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRB1P04280 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRB1P04280 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRB1P04280 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRB1P04280 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRB1P04280 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRB1P04280 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRB1P04280 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRB1P04280 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRB1P04280 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRB1P04280 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRB1P04280 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRB1P04280 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRB1P04280 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRB1P04280 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRB1P04280 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRB1P04280 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRB1P04280 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRB1P04280 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRB1P04280 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRB1P04280 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRB1P04280 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRB1P04280 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRB1P04280 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRB1P04280 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRB1P04280 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRB1P04280 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRB1P04280 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRB1P04280 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRB1P04280 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms