Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9P02748 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C9P02748 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9P02748 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9P02748 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9P02748 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C9P02748 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C9P02748 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9P02748 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9P02748 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C9P02748 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C9P02748 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9P02748 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C9P02748 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9P02748 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9P02748 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9P02748 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9P02748 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9P02748 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C9P02748 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C9P02748 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9P02748 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9P02748 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9P02748 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9P02748 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9P02748 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9P02748 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9P02748 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9P02748 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9P02748 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9P02748 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9P02748 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9P02748 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9P02748 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9P02748 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9P02748 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9P02748 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9P02748 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9P02748 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9P02748 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9P02748 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9P02748 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9P02748 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9P02748 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9P02748 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9P02748 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9P02748 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9P02748 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9P02748 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9P02748 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9P02748 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9P02748 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9P02748 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9P02748 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9P02748 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9P02748 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9P02748 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9P02748 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C9P02748 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9P02748 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9P02748 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C9P02748 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9P02748 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9P02748 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9P02748 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9P02748 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9P02748 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9P02748 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9P02748 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C9P02748 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C9P02748 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9P02748 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9P02748 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9P02748 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9P02748 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9P02748 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9P02748 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9P02748 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9P02748 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9P02748 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C9P02748 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9P02748 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9P02748 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9P02748 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9P02748 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9P02748 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C9P02748 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9P02748 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9P02748 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9P02748 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9P02748 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9P02748 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9P02748 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9P02748 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9P02748 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9P02748 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9P02748 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9P02748 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9P02748 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C9P02748 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms