Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC4A1P02730 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC4A1P02730 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC4A1P02730 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC4A1P02730 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC4A1P02730 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms