Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMNAP02545 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNAP02545 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNAP02545 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNAP02545 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMNAP02545 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNAP02545 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMNAP02545 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNAP02545 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMNAP02545 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMNAP02545 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMNAP02545 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNAP02545 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNAP02545 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNAP02545 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMNAP02545 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNAP02545 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNAP02545 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNAP02545 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNAP02545 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMNAP02545 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNAP02545 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNAP02545 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNAP02545 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMNAP02545 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNAP02545 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNAP02545 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNAP02545 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMNAP02545 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMNAP02545 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMNAP02545 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNAP02545 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNAP02545 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNAP02545 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMNAP02545 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNAP02545 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNAP02545 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNAP02545 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNAP02545 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNAP02545 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNAP02545 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNAP02545 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNAP02545 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNAP02545 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNAP02545 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNAP02545 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNAP02545 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNAP02545 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNAP02545 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNAP02545 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNAP02545 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNAP02545 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNAP02545 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNAP02545 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNAP02545 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNAP02545 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMNAP02545 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
LMNAP02545 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNAP02545 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNAP02545 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNAP02545 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNAP02545 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNAP02545 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNAP02545 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNAP02545 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNAP02545 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNAP02545 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNAP02545 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNAP02545 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNAP02545 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNAP02545 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNAP02545 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNAP02545 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNAP02545 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNAP02545 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNAP02545 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNAP02545 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNAP02545 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNAP02545 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNAP02545 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNAP02545 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNAP02545 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNAP02545 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNAP02545 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNAP02545 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNAP02545 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNAP02545 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNAP02545 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LMNAP02545 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNAP02545 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNAP02545 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNAP02545 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNAP02545 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNAP02545 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNAP02545 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNAP02545 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMNAP02545 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNAP02545 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNAP02545 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LMNAP02545 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms