Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Lamc1P02468 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Lamc1P02468 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Lamc1P02468 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Lamc1P02468 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Lamc1P02468 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Lamc1P02468 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Lamc1P02468 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lamc1P02468 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lamc1P02468 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lamc1P02468 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lamc1P02468 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Lamc1P02468 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Lamc1P02468 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lamc1P02468 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lamc1P02468 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Lamc1P02468 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Lamc1P02468 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Lamc1P02468 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms