Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tp53P02340 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tp53P02340 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tp53P02340 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tp53P02340 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tp53P02340 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tp53P02340 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tp53P02340 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tp53P02340 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tp53P02340 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tp53P02340 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tp53P02340 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tp53P02340 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tp53P02340 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tp53P02340 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tp53P02340 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tp53P02340 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tp53P02340 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tp53P02340 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tp53P02340 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tp53P02340 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tp53P02340 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tp53P02340 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tp53P02340 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tp53P02340 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tp53P02340 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tp53P02340 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tp53P02340 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tp53P02340 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tp53P02340 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms