Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
H2-Ab1P01921 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-Ab1P01921 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Ab1P01921 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms