Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01673 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01673 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01673 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01673 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01673 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01673 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01673 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01673 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01673 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
P01673 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01673 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01673 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01673 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01673 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01673 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01673 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01673 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01673 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01673 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01673 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01673 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01673 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01673 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01673 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01673 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01673 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01673 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01673 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01673 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01673 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01673 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01673 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01673 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01673 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01673 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01673 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01673 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01673 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01673 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01673 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01673 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01673 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01673 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
P01673 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01673 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01673 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01673 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01673 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01673 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01673 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01673 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01673 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01673 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01673 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01673 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P01673 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P01673 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01673 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01673 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01673 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01673 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01673 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
P01673 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01673 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01673 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01673 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01673 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01673 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01673 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01673 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01673 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01673 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01673 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01673 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01673 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01673 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01673 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
P01673 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01673 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01673 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01673 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01673 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01673 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01673 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
P01673 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
P01673 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01673 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01673 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01673 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01673 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01673 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01673 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01673 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01673 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01673 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01673 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01673 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01673 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01673 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms