Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01659 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01659 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01659 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01659 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01659 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01659 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01659 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01659 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01659 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01659 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01659 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01659 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01659 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01659 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01659 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01659 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01659 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01659 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01659 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01659 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01659 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01659 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01659 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01659 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01659 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01659 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01659 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01659 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01659 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01659 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01659 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01659 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01659 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01659 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01659 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01659 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01659 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01659 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01659 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01659 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01659 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01659 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01659 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01659 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01659 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01659 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01659 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01659 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01659 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01659 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01659 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01659 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01659 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01659 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01659 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01659 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01659 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01659 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01659 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01659 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01659 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01659 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01659 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01659 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01659 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01659 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01659 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01659 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01659 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01659 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01659 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01659 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01659 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01659 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01659 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01659 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01659 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01659 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01659 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01659 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01659 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01659 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01659 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01659 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01659 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P01659 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01659 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01659 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01659 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01659 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01659 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01659 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01659 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01659 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01659 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01659 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01659 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01659 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01659 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms