Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abl1P00520 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abl1P00520 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abl1P00520 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Abl1P00520 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abl1P00520 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abl1P00520 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abl1P00520 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abl1P00520 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abl1P00520 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abl1P00520 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abl1P00520 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abl1P00520 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abl1P00520 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abl1P00520 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Abl1P00520 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Abl1P00520 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Abl1P00520 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Abl1P00520 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abl1P00520 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abl1P00520 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abl1P00520 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Abl1P00520 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms