Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MAP4K4O95819 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
MAP4K4O95819 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MAP4K4O95819 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
MAP4K4O95819 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MAP4K4O95819 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MAP4K4O95819 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MAP4K4O95819 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MAP4K4O95819 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MAP4K4O95819 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
MAP4K4O95819 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MAP4K4O95819 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MAP4K4O95819 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
MAP4K4O95819 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
MAP4K4O95819 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MAP4K4O95819 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MAP4K4O95819 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MAP4K4O95819 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MAP4K4O95819 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MAP4K4O95819 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MAP4K4O95819 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MAP4K4O95819 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms