Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX3O95343 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIX3O95343 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX3O95343 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIX3O95343 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX3O95343 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX3O95343 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIX3O95343 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIX3O95343 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIX3O95343 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX3O95343 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX3O95343 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX3O95343 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIX3O95343 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX3O95343 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX3O95343 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIX3O95343 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX3O95343 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX3O95343 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX3O95343 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX3O95343 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX3O95343 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIX3O95343 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX3O95343 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX3O95343 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX3O95343 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX3O95343 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIX3O95343 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX3O95343 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX3O95343 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIX3O95343 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX3O95343 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIX3O95343 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX3O95343 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX3O95343 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX3O95343 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX3O95343 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX3O95343 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX3O95343 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX3O95343 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIX3O95343 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX3O95343 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SIX3O95343 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX3O95343 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SIX3O95343 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX3O95343 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX3O95343 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX3O95343 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX3O95343 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX3O95343 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SIX3O95343 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX3O95343 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX3O95343 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX3O95343 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX3O95343 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX3O95343 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX3O95343 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX3O95343 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SIX3O95343 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX3O95343 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SIX3O95343 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX3O95343 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX3O95343 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX3O95343 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SIX3O95343 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX3O95343 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX3O95343 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX3O95343 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX3O95343 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX3O95343 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SIX3O95343 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX3O95343 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX3O95343 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX3O95343 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX3O95343 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIX3O95343 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIX3O95343 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX3O95343 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX3O95343 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX3O95343 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX3O95343 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIX3O95343 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX3O95343 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX3O95343 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX3O95343 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX3O95343 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX3O95343 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX3O95343 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX3O95343 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIX3O95343 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIX3O95343 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SIX3O95343 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX3O95343 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX3O95343 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIX3O95343 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX3O95343 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX3O95343 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIX3O95343 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX3O95343 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIX3O95343 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms