Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATE1O95260 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATE1O95260 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATE1O95260 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATE1O95260 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATE1O95260 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATE1O95260 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATE1O95260 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATE1O95260 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATE1O95260 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATE1O95260 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATE1O95260 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATE1O95260 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATE1O95260 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATE1O95260 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATE1O95260 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATE1O95260 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATE1O95260 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATE1O95260 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATE1O95260 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATE1O95260 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATE1O95260 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATE1O95260 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATE1O95260 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATE1O95260 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATE1O95260 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATE1O95260 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATE1O95260 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATE1O95260 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATE1O95260 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATE1O95260 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATE1O95260 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATE1O95260 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATE1O95260 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATE1O95260 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATE1O95260 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATE1O95260 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATE1O95260 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATE1O95260 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATE1O95260 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATE1O95260 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATE1O95260 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATE1O95260 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATE1O95260 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATE1O95260 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATE1O95260 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATE1O95260 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATE1O95260 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATE1O95260 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATE1O95260 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATE1O95260 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATE1O95260 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATE1O95260 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATE1O95260 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATE1O95260 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATE1O95260 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATE1O95260 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATE1O95260 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATE1O95260 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATE1O95260 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATE1O95260 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATE1O95260 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATE1O95260 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATE1O95260 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATE1O95260 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATE1O95260 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATE1O95260 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATE1O95260 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATE1O95260 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATE1O95260 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATE1O95260 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATE1O95260 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATE1O95260 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATE1O95260 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATE1O95260 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATE1O95260 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATE1O95260 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATE1O95260 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATE1O95260 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATE1O95260 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATE1O95260 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATE1O95260 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATE1O95260 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATE1O95260 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATE1O95260 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATE1O95260 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATE1O95260 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATE1O95260 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATE1O95260 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATE1O95260 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATE1O95260 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATE1O95260 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATE1O95260 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATE1O95260 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATE1O95260 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATE1O95260 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATE1O95260 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATE1O95260 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATE1O95260 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATE1O95260 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms