Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKD3O94806 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKD3O94806 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKD3O94806 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKD3O94806 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms