Protein–RNA interactions for Protein: O89006

Magea1, Magea1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Magea1O89006 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Magea1O89006 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Magea1O89006 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Magea1O89006 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Magea1O89006 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Magea1O89006 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Magea1O89006 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Magea1O89006 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Magea1O89006 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Magea1O89006 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Magea1O89006 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Magea1O89006 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Magea1O89006 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Magea1O89006 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Magea1O89006 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Magea1O89006 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Magea1O89006 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Magea1O89006 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Magea1O89006 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Magea1O89006 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Magea1O89006 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Magea1O89006 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Magea1O89006 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Magea1O89006 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Magea1O89006 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Magea1O89006 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Magea1O89006 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Magea1O89006 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Magea1O89006 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Magea1O89006 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Magea1O89006 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Magea1O89006 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Magea1O89006 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Magea1O89006 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Magea1O89006 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Magea1O89006 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Magea1O89006 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Magea1O89006 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Magea1O89006 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Magea1O89006 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Magea1O89006 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Magea1O89006 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Magea1O89006 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Magea1O89006 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Magea1O89006 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Magea1O89006 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Magea1O89006 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Magea1O89006 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Magea1O89006 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Magea1O89006 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Magea1O89006 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms